单细胞技术类型
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单细胞测序是指通过对单个细胞进行基因组、转录组及表观基因组水平的测序,获得相应数据并进行信息分析。单细胞测序可以解决用组织样本测序无法解决的细胞异质性难题,为解析单个细胞的行为、机制及其与机体的关系等提供了新方法。

2011年,《Nature Methods》将单细胞测序列为年度值得期待的技术之一[1],2013年,《Science》将单细胞测序列为年度最值得关注的六大领域榜首[2]。同年,单细胞Hi-C[3]测序技术的出现,使单细胞基因组研究正式迈向了3D时代。

目前,安诺基因掌握最领先最全面的单细胞测序技术,从基因组学、转录组学到表观组学,从二维到3D,涵盖三大组学,包括五项高端技术。
  • 单细胞基因组测序
  • 单细胞转录组测序
  • 单细胞甲基化测序
  • 单细胞Hi-C测序
  • 单细胞G&T-Seq

单细胞全基因组测序技术是在单细胞水平对全基因组进行扩增与测序的一项新技术。其原理是将分离的单个细胞的微量全基因组DNA进行扩增,获得高覆盖率的完整的基因组之后通过高通量测序用于揭示细胞群体差异和细胞分化关系。

全基因组扩增技术主要有两种:多次退火循环扩增技术(MALBAC)和多重置换扩增(MDA)扩增技术。安诺基因全基因组扩增采用改进的MALBAC方法,MALBAC扩增具有低偏倚性的特点, 与M D A 相比,MALBAC扩增后的数据与混合建库的数据质量更为接近[4]

MALBAC扩增与MDA扩增后的数据比较[4]

物种经验

技术路线

产品参数

信息分析

单细胞转录组测序技术主要用于在全基因组范围内挖掘基因调节网络,尤其适用于存在高度异质性的干细胞/肿瘤细胞及胚胎发育早期的细胞群体。单细胞转录组分析有助于深入理解细胞分化、细胞重编程及转分化等过程及相关的基因调节网络。

安诺基因转录组扩增采用改进的SMART-seq2技术,能够满足高敏感度、无偏好性的cDNA转录本的扩增[5]

Smart-seq2和SMARTer建库方法扩增后的数据比较[5]

物种经验

技术路线

产品参数

信息分析

安诺基因单细胞甲基化测序技术包括单细胞重亚硫酸盐测序技术(BS)和单细胞简化代表性重亚硫酸盐测序技术(RRBS)测序。在单细胞BS/RRBS测序的帮助下,人们可以探索细胞之间的表观异质性,得到单细胞甲基化图谱,进一步理解受精卵的发育机制,更好地治疗癌症和不孕不育。

单细胞BS测序建库方法[6]

单细胞RRBS测序建库方法[7]

物种经验

技术路线

产品参数

信息分析

单细胞Hi-C技术是在Hi-C技术的基础之上发展而来,Hi-C通过来自于大量群体细胞获得平均数据来评估染色体折叠和潜在的相互作用,单细胞Hi-C则能够分辨单个染色体的构象模型,并阐明染色体的相互作用以及基因组功能的受控机制。该技术适用于稀少细胞以及处于特殊形态细胞的染色体功能构象解析。

单个细胞对比群体细胞的染色体构象[8]
(绿色代表活化的染色体,橙色代表活性受抑制的染色体)

物种经验

技术路线

产品参数

信息分析

单细胞基因组与转录组平行测序技术(Genome and Tranome Sequencing),该技术实现了对单个细胞内的DNA和RNA平行测序,能够展现单个细胞的基因变异与基因功能之间的关系。

G&T-Seq这一整合的技术的重要意义在于可以分析单细胞基因型和表型之间的关系,深刻揭示一个细胞内的DNA信息指导细胞状态的调控机制,真正实现了在一个时空内遗传物质的综合研究。

单细胞G&T-Seq技术原理[10]

物种经验

技术路线

产品参数

信息分析

产品优势

安诺基因团队与法国居里研究所、北医三院、南京医科大学等多家科研院所已有丰富的单细胞测序技术合作经验,参与了多项单细胞研究工作,相关研究成果已在Developmental Cell等高水平期刊上发表[9]
安诺基因实验团队对经典的单细胞建库方法进行改进,文库具有良好的成功率和稳定性。此外,我们的测序质量及基因组比对率/覆盖率等质控指标也非常优秀,如表1、2、3所示(真实项目数据)。
提供基因组学、转录组学及表观基因组学等不同层次的单细胞测序分析服务,满足各个层次的科研需求。
除标准信息分析外,还可通过与合作伙伴共同研究探讨,针对不同项目制定个性化的信息分析方案,保证结果的创新型和可用性。

应用领域

技术平台

  • 全面的高通量测序平台
    • HiSeq 2500/4000、NextSeq 500、MiSeq 等系列高通量测序仪
    • 大批量样本检测能力
    • 高效的数据产出率
  • 领先的优乐娱乐信息分析平台
    • 大规模数据存储、计算和分析能力
    • 精准的分析流程
    • 核心算法具有自主知识产权
  • 自动化样本处理平台
    • 依据ISO/IEC 17025 及GLP 标准建立的质量保证体系
    • 全程高度自动化,样本处理均一、稳定
    • 日均上千份样本的处理能力
  • 现代化优乐娱乐样本库
    • 大批量、多类型优乐娱乐样本储存能力
    • 信息化、智能化样本信息储存系统
    • 规范化、标准化样本管理流程和制度
  • 行业一流的医学检验所
    • 依据ISO/IEC 15189 标准建立的质量保证体系
    • 3000 平米临床细胞分子遗传学专业检验实验室
    • 顶尖的检测设备、领先的检测技术

荣誉资质

关于我们

安诺优达基因科技(北京)有限公司总部位于北京,是中国基因组行业的知名企业,并被认定为国家级高新技术企业。公司于2012年成立,专注于新一代基因组学技术在生命科学研究和人类医学健康两大领域的产业化应用。

安诺基因作为安诺优达旗下注册品牌,立足于核心海内外人才团队,拥有自主研发的领先基因组测序和优乐娱乐信息学技术,建立了领先的高通量测序平台和高性能计算平台,形成了强大的Bio-IT基础和产业化服务能力。

安诺基因专注于科技服务领域,致力于为医学和生命科学研究提供最优秀的技术解决方案,致力成为中国科技服务的第一品牌。我们在基因组学、转录组学及表观组学等多组学水平与国内外高校院所、医院以及研发机构广泛开展科研合作,涉及领域包括人类重大疾病基础研究、动植物分子育种、遗传与进化、环境微优乐娱乐和生态环境研究等,并已在基因表达分析、单细胞测序技术、Hi-C测序技术等国际热点研究领域形成特色优势,引领基因组学从“个体”走向“细胞”水平,从二维迈向三维时代。

参考文献

  1. de Souza, N. Single-cell methods. Nature Methods. 2011, 9(1): 35.
  2. Pennisi, E. Single-cell sequencing tackles basic and biomedical questions. Science. 2012, 336(6084): 976-977.
  3. Nagano T, et al. Single-cell Hi-C reveals cell-to-cell variability in chromosome structure. Nature, 2013, 502(7469): 59-64.
  4. Zong, C., et al. Genome-wide detection of single nucleotide and copy number variations of a single human cell. Science. 2012, 338(6114): 1622-1626.
  5. Picelli, S., et al. Smart-seq2 for sensitive full-length transcriptome profiling in single cells. Nature Methods. 2013, 10(11): 1096-1098.
  6. Smallwood S A, et al. Single-cell genome-wide bisulfite sequencing for assessing epigenetic heterogeneity. Nature methods, 2014, 11(8): 817-820.
  7. Guo H, et al. Single-cell methylome landscapes of mouse embryonic stem cells and early embryos analyzed using reduced representation bisulfite sequencing. Genome research, 2013, 23(12): 2126-2135.
  8. Dekker J, Mirny L. Biological techniques: chromosomes captured one by one. Nature, 2013, 502(7469): 45-46.
  9. Gendrel, A.V., Attia, M., Chen, C.J., et al. Developmental dynamics and disease potential of random monoallelic gene expression. Developmental Cell. 2014, 28(4):366-380.
  10. Iain C Macaulay , et al. G&T-seq: parallel sequencing of single-cell genomes and transcriptomes. Nature Methords. 2015, 12(6): 519-522.
  1. 电话:4008-986-980  邮箱:service@genome.cn 网址:www.genome.cn 微博:weibo.com/genome01
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